我國對地理標志產品保護實施兩級管理。國家質檢總局作為地理標志產品保護工作的主管部門，組織對地理標志產品保護申請進行審核、確認保護地域范圍、產品名稱和專用標志的注冊登記等管理工作。
    產品所在地的出入境檢驗檢疫局和質量技術監(jiān)督局是具體開展保護地理標志產品工作的機構，負責對地理標志產品進行日常監(jiān)管。出口企業(yè)的地理標志產品的保護工作主要由出入境檢驗檢疫部門負責；其他地理標志產品的保護工作主要由質量技術監(jiān)督部門負責。具體主要包括：對地理標志產品保護申請?zhí)岢龀鯇徱庖姡付z驗機構承擔地理標志產品保護的質量檢驗，受理和審核使用地理標志產品專用標志的申請，對地理標志保護產品實施保護、查處違法行為和進行日常監(jiān)督管理等等。